薄层色谱和柱色谱在分离时并不一致,在薄层色谱中分离的很好，但过柱子仍有可能产生交叉（分不开）
薄层色谱对柱层析有一定的指导作用,比如溶剂的选择,但溶剂的比例无法准确确定（毕竟一个往上跑一个往下跑）
一般而言,柱色谱的比例比薄层要放大10倍,尤其是起步溶剂,比如薄层板是10:1时,柱子最好100:1
当一个梯度被洗脱下来的样品不多时就可以换梯度（可以通过点板来监测洗脱下来的样品的量）
一般对半减,如100:1 50:1 20:1 10:1 …
如果样品量不是很大的话,可以用一个比较小极性的溶剂慢慢的洗脱,终究会被冲下来,而且一般效果比换梯度要好.
分离很多时候的重现性不是很好